偶看新闻王者之魄活动:neigh_modify command analysis
来源：百度文库 编辑：偶看新闻 时间：2024/05/03 08:03:18
用来设定计算邻位列表的频率。
Delay： never build a new list until at least N steps after the previous build 在建立一次邻位列表后，至少要经过N steps才能建立下一次的邻位列表。
Every：在delay经过之后，每经过M步建立一次邻位列表。个人感觉lammps中这点写的有点混乱。个人理解：每建立一次列表后，经过N+M才能建立下一次列表。如果N不为零，必须为M的倍数，否则没有什么意义了。这里为什么非要这种设置呢，如果设置频率的话只需要一个参数就够了啊？http://simulation.5d6d.scom/viewthread.php?tid=8245&page=1#pid52602
Check：如果值为no，则只需要满足以上两者的设定后就可以重新建立邻位列表了。如果值为yes，则只有当某个原子的位移大于皮肤半径的一半才重新建立列表。
Exclude：用来取消某些原子之间的相互作用。对于以下几种情况很重要：裂纹模拟；冰冻处理；原子被设定为刚体时；这中处理方式可以节约计算时间。这个只影响原子间非键结的相互作用。
Page and one：关于邻位列表的存储问题。
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恩，仔细看了下你写的分析过程，结合原始程序，基本上明白了这两个参数的作用。其实，建立邻位列表的频率是由delay every check三个参数共同确定的。
if (ago >= delay && ago % every == 0)//这是最基本的条件
{
if (dist_check == 0) return 1;//当dist_check==0的时候，邻位列表定期更新
else return check_distance();//当dist_check！=0的时候，就是标签更新，只有当列表中某个原子的位移大于skin的一半的时候才建立
}
else return 0;
其实首先要明白，更新列表有两种方式，一种是定期更新，另外一种是标签更新。
因此，如果delay为零，则不管dist_check如何取值，只要当时间步是every的倍数就可以更新列表
如果delay不为零，every==1，并且dist_check==0，则更新列表的频率与every没有什么关系，只要距离上次更新列表的时间步达到delay就更新。
而如果delay不为零，every不为1时，手册中有要求，“如果delay不为零，他的值必须是every的倍数”。因此，如果dist_check==0，则时间步达到delay+every，则列表就开始更新。而如果dist_check不为零，则只有当时间步为delay+N*every（N=0,1,2……）的时候，邻位列表才更新。