贵阳观山湖区立新小学:总mRNA的提取(自己的经验):摘自生物在线
来源:百度文库 编辑:偶看新闻 时间:2024/05/05 05:39:46
一、 关于Trizol Reagent需要的试剂
1. Chloroform:氯仿(分析纯)
2. Isoproplyl alcohol:异丙醇(分析纯)
3. 75% Ethanol(in DEPC-treated water):75%乙醇。要求用分析纯无水乙醇并用0.01%的DEPC处理过的无Rnase的水稀释。
4. RNase-free water:无Rnase的水。方法是:将DEPC按0.01%(V/V)加在d H2O中500ml(50ul),在37℃过夜,并高压灭菌即得(150℃ 3小时)
5. 一次性塑料手套
6. 注意:DEPC有致癌之嫌
二、 关于Trizol Reagent的使用过程:
1. Homogenization(匀浆)
a. Tissues:组织
每100mg组织匀浆加1mlTrizol试剂,样品体积不能超过Trizol试剂的10%。
1) 组织接入预冷的EP管中,加入Trizol试剂1ml/10cm2(量一定要加足,否则易污染),混匀,吹吸几次,以破裂细胞,置室温5min,以使核蛋白复合物彻底分离。
(2) 加氯仿0.2ml(每1ml Trizol试剂加入氯仿0.2ml),盖好,剧烈震荡15s,置室温2-3分钟。
(3) 4℃离心,10000g×15min,离心后,混合物将分离为底层为浅红的、中层为酚-氯仿相、上层为无色的水相。RNA包含在水相中,水相的体积约相当于所加的Trizol试剂量的60%。
(4) 仔细吸取上层水相,移至另一EP管中。
(5) 加0.5ml异丙醇,以沉淀RNA(每1ml Trizol试剂加入0.5ml异丙醇),置室温10min。
(6) 4℃离心,10000g×10min。RNA沉淀为一层如凝胶样透明的小块附在管底和管壁。
(7) 弃上清液,加入预冷的75%乙醇1ml(每1ml Trizol试剂加入75%乙醇至少1ml),震荡,充分洗涤沉淀,4℃离心,5500g×5min。弃上清液,空气干燥(或真空干燥)后,沉淀重悬于无 Rnase dH2O中,吹吸几次,55℃-60℃作用10分钟以溶解RNA,-70℃保存备用。
RNA定量:
RNA也最好至少要用电泳,一方面定量,另一方面可以看看完整性。至于用分光光度计比较 不同标本之间就更不准了。
RNA的贮藏,最主要的是温度,-20不够,最好-80,液氮最保险。
mRNA是不能代替蛋白水平的分析的,因为还有翻译效率和RNA降解速度的影响。
防止RNA酶污染的措施:
1. 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。
2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。
3. 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10min,然后用0.1% DEPC水冲洗,晾干。
4. 配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。
5. 操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。
6. 设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用。
1. Chloroform:氯仿(分析纯)
2. Isoproplyl alcohol:异丙醇(分析纯)
3. 75% Ethanol(in DEPC-treated water):75%乙醇。要求用分析纯无水乙醇并用0.01%的DEPC处理过的无Rnase的水稀释。
4. RNase-free water:无Rnase的水。方法是:将DEPC按0.01%(V/V)加在d H2O中500ml(50ul),在37℃过夜,并高压灭菌即得(150℃ 3小时)
5. 一次性塑料手套
6. 注意:DEPC有致癌之嫌
二、 关于Trizol Reagent的使用过程:
1. Homogenization(匀浆)
a. Tissues:组织
每100mg组织匀浆加1mlTrizol试剂,样品体积不能超过Trizol试剂的10%。
1) 组织接入预冷的EP管中,加入Trizol试剂1ml/10cm2(量一定要加足,否则易污染),混匀,吹吸几次,以破裂细胞,置室温5min,以使核蛋白复合物彻底分离。
(2) 加氯仿0.2ml(每1ml Trizol试剂加入氯仿0.2ml),盖好,剧烈震荡15s,置室温2-3分钟。
(3) 4℃离心,10000g×15min,离心后,混合物将分离为底层为浅红的、中层为酚-氯仿相、上层为无色的水相。RNA包含在水相中,水相的体积约相当于所加的Trizol试剂量的60%。
(4) 仔细吸取上层水相,移至另一EP管中。
(5) 加0.5ml异丙醇,以沉淀RNA(每1ml Trizol试剂加入0.5ml异丙醇),置室温10min。
(6) 4℃离心,10000g×10min。RNA沉淀为一层如凝胶样透明的小块附在管底和管壁。
(7) 弃上清液,加入预冷的75%乙醇1ml(每1ml Trizol试剂加入75%乙醇至少1ml),震荡,充分洗涤沉淀,4℃离心,5500g×5min。弃上清液,空气干燥(或真空干燥)后,沉淀重悬于无 Rnase dH2O中,吹吸几次,55℃-60℃作用10分钟以溶解RNA,-70℃保存备用。
RNA定量:
RNA也最好至少要用电泳,一方面定量,另一方面可以看看完整性。至于用分光光度计比较 不同标本之间就更不准了。
RNA的贮藏,最主要的是温度,-20不够,最好-80,液氮最保险。
mRNA是不能代替蛋白水平的分析的,因为还有翻译效率和RNA降解速度的影响。
防止RNA酶污染的措施:
1. 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。
2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。
3. 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10min,然后用0.1% DEPC水冲洗,晾干。
4. 配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。
5. 操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。
6. 设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用。
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