巴吉赛车的后悬挂图片:微生物基因组注释和基因预测工具:Glimmer

来源：百度文库编辑：偶看新闻时间：2024/04/29 18:52:44

Glimmer简介
Glimmer用于微生物DNA的基因预测，特别是细菌、古细菌、和病毒等的基因组。Glimmer（Gene Locator and Interpolated Markov ModelER）采用内插马尔可夫模型（interpolated Markov models，IMMs）来识别编码区域和从非编码的DNA中区分出来。

关于IMM的详细介绍，你可以去看这两篇文献： Nucleic Acids Research paper on Glimmer 1.0 and in our subsequent paper on Glimmer 2.0

TIGR（Institute for Genomic Research，美国基因组研究所）就是把Glimmer作为预测微生物基因的主要工具。至令已经预测了超过100种细菌的基因组。

但是这个软件并不适合真核生物。真核生物有其它专门的软件，这在以后介绍。

Glimmer主页
http://www.cbcb.umd.edu/software/glimmer/

Glimmer下载（用于类unix系统）
Download Glimmer v3.02： http://www.cbcb.umd.edu/software/glimmer/glimmer302.tar.gz

Glimmer安装
wget http://www.cbcb.umd.edu/software/glimmer/glimmer302.tar.gz (下载)
tar zcvf glimmer302.tar.gz （解压，解压后目录为glimmer3.02）
cd glimmer3.02/src （进入src目录）
make （安装）Glimmer用法
glimmer3.02/docs/notes.pdf (docs目录下的notes.pdf里有详细的用法介绍)。或是以后有需要再详解。

Glimmer的在线运行
主页：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/glimmer_3.cgi

直接把微生物或病毒的基因组序列（Fasta格式）粘贴在文本框就行了。Glimmer程序预测基因比较严格，例如相对于ORF finder。

染色体`DNA``基因``基因组``````晕`了`` 什么是cDNA克隆？基因组克隆？一个基因的cDNA克隆和基因组克隆可能在大小上有很大的区别，为什么？基因组中两个基因所控性状是否相同？原核基因组和真核基因组有何特点？比较真核基因组和原核基因组的异同？显性基因和隐性基因关于photoshop 的注释工具基因检测,最新的健康预测手段 2004年科学家对鸡的基因组序列草图分析，说明鸡有约60%的基因与人相同，鸡和人在约3.1亿年前拥有共同的祖寻下诗注释和资料寻下词注释和资料寻下词注释和资料。寻下诗注释和资料寻下词注释和资料寻下诗注释和资料 PHTOSHOP注释工具有什么用？现分离得到一个青霉素的单基因的抗高温突变体，设计方案，克隆、分离该基因（青霉素基因组测序尚未进行）有谁知道预测基因甲基化应该用什么软件？有谁知道预测基因甲基化应该用什么软件？宝宝基因预测机哪有买，请告知价格，谢谢什么是食品科学和微生物工程？微生物的特征和分布工业微生物和医学微生物的奠基人是谁？微生物基因序列对比差异大于多少可判定为不同种属？