奔驰消防进口车价格:Rt -PCR实验操作步骤

来源:百度文库 编辑:偶看新闻 时间:2024/04/28 20:59:23

RT-PCR实验操作步骤 (转)

默认分类 2007-12-25 17:51:05 阅读233 评论1   字号: 订阅

一.所用试剂

 1.0.01MPBS缓冲液,PH7.4 :高压灭菌,40C保存。临用前-200C放置30分钟,确保冰冷。

 2.焦碳酸二乙酯(DEPC):sigma公司,40C保存。

 3.0.1%DEPC处理的灭菌去离子水:100ml去离子水中加入0.1mlDEPC,剧烈振荡混匀,让DEPC充分进入溶液中,370C放置过夜,高压蒸汽灭菌30分钟除去DEPC。40C保存。

 4.单相细胞裂解试剂TRizoL:Invitrogen生命技术公司,40C保存。临用前-200C放置30分钟,确保冰冷。

 5.氯仿:用新开封的,10ml分装,40C保存。临用前-200C放置30分钟,确保冰冷。

 6.异丙醇:用新开封的,20ml分装,40C保存。临用前-200C放置30分钟,确保冰冷。

 7.0.1%DEPC处理的75%乙醇:无水乙醇75ml加0.1%DEPC处理的灭菌去离子水至100ml,4C保存。临用前-200C放置30分钟,确保冰冷。

 8.cDNA反转录试剂盒:MBI公司,-200C保存。

 9.2xPCR试剂:MBI公司,-200C保存。

 10.5xTBE RNA电泳缓冲液:因为Tris碱可与DEPC发生反应并使之失活,所以含Tris碱的电泳缓冲液可用DEPC处理的灭菌去离子水配制,0.22um滤器过滤除菌。室温保存,临用前用DEPC处理的灭菌去离子水10倍稀释。使用本室RNA专用电泳槽,每次需配制0.5x电泳缓冲液500ml。

 11.50xTAE DNA电泳缓冲液:室温保存,临用前用去离子水50倍稀释。使用本室DNA专用电泳槽,每次需配制1x电泳缓冲液1000ml。

 12.6x上样缓冲液:1.5mlDEPC处理的灭菌离心管中称取2.5mg溴酚蓝,加入0.3ml甘油,DEPC处理的灭菌去离子水定容至1ml,40C保存。

 13.1.5%琼脂糖:RNA电泳,1.5g琼脂糖加入0.5xTBE RNA电泳缓冲液中;DNA电泳, 1.5g琼脂糖加入1xTAE DNA电泳缓冲液中。微波炉煮沸熔化后,冷却至600C左右,每100ml胶加入溴化乙啶(EB,10mg/ml)5ul。

 14.溴化乙锭(10mg/ml):在100ml水中加入1g溴化乙锭,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中,保存于室温。

 15.人淋巴细胞分离液:上海华精生化试剂厂。

二.总RNA提取

[注]1.本方法采用Chomczynski一步法,用单相细胞裂解试剂TRizoL破碎细胞和灭活细胞中内源性RNA酶同步进行,可同时分离RNA、DNA和蛋白质。TRizoL中含有酚、强变性剂硫氰酸狐和溶解剂等。本法所提取的RNA可用于RT-PCR、Northern印迹杂交等。

    2.最好单独存放用于RNA实验的试剂,以防止污染。

    3.耐高温的匀浆器、研钵及研棒用锡箔纸包好,2000C干烤5小时,灭活外源性RNA酶。

    4.离心管、枪头等塑料制品用0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液浸泡12小时以上灭活外源性RNA酶。再用去离子水浸泡10分钟x3次,以去除DEPC,然后70-800C烤干,高压蒸汽灭菌30分钟除去残留的DEPC,以防DEPC通过羧甲基化作用对RNA的嘌呤碱基进行修饰。

    5.提取RNA所用的去离子水及配制试剂均要经含0.1%DEPC处理。   

    6.如果是从完整包装中新取出的塑料制品,一般无外源性RNA酶污染,可以直接使用。

    7.实验者的双手是外源性RNA酶的重要污染源,因此务必戴手套进行操作。

    8.DEPC为可疑致癌物,且有芳香性挥发气味,使用时应戴手套、口罩,并打开排气扇。

    9.RNA紫外分光光度计定量所用石英比色皿使用后,在1:1盐酸甲醇中浸泡30分钟以上,再用0.1%DEPC处理去离子水冲洗干净,凉干。

    10.用于RNA电泳的电泳槽用去污剂清洗干净,自来水冲洗数次,再用去离子水冲洗1次,无水乙醇擦洗,干燥。然后灌满3%的双氧水室温放置10分钟,最后用DEPC处理的去离子水冲洗3次。

    11.提取的RNA经琼脂糖凝胶电泳后,28S rRNA和18S rRNA应当能清楚地在紫外分析仪下看到,也应当能看到一条由tRNA, 5.8S rRNA和5S rRNA组成的,较模糊迁移较快的带。如果RNA没有被降解,28S rRNA的亮度应当是18S rRNA亮度的两倍,且这两条带都没有弥散现象。加样孔附近有条带表明产物中混有DNA。

(一).培养细胞中RNA提取

 1.贴壁生长的细胞:倒出培养液,加5ml无菌冰冷的PBS缓冲液冲洗细胞2次。倒出PBS缓冲液(尽量空干),加入1mlTRizoL,用力振荡培养瓶或培养皿(贴壁较牢固的细胞可用细胞刮刀刮取细胞),使细胞完全脱落,用加样器吹打均匀,吸入1.5ml离心管中,漩涡混匀器振荡30秒,室温静置5分钟,使核蛋白完全从核酸上解离。悬浮生长的细胞:细胞悬液倒入10-15ml离心管,2000转/分离心10分钟收集细胞,倒出培养液,加2ml无菌冰冷的PBS缓冲液,混匀使细胞沉淀重悬洗涤细胞2次。再2000转/分离心10分钟收集细胞,倒出PBS缓冲液(尽量空干),加入1mlTRizoL,用加样器吹打均匀,吸入1.5ml离心管中,漩涡混匀器振荡30秒,室温静置5分钟,使核蛋白完全从核酸上解离。

 2.加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡30秒,冰盒上静置10分钟,

 3.高速冷冻离心机(温度设定40C)12000/分离心15分钟,使混合物分为两相(RNA留在水相,DNA和蛋白质被抽提进氯仿层),吸取上层水相0.5ml移至一个新的1.5ml离心管中,加异丙醇0.5ml。充分混匀,冰盒上静置10分钟,使RNA充分沉淀。

 4.高速冷冻离心机(温度设定40C)12000/分离心15分钟,弃去上清液,加入冰冷75%乙醇1ml洗涤RNA沉淀,漩涡混匀器振荡30秒.

 5.高速冷冻离心机(温度设定40C)8000/分离心5分钟,弃去上清液,沉淀快速风干。但不要完全干燥这一点非常重要,否则RNA沉淀溶解度会大大降低。可通过在55-600C加热并用枪头反复吹打溶液增加RNA的溶解度。

 6.提取的RNA加适量DEPC处理去离子水溶解(组织及培养细胞所提RNA加水50-100ul外周血白细胞所提RNA加水10-15ul)。取5ul+1ul6x电泳上样缓冲液点样,电压120-130V电泳30分钟左右,如在紫外分析仪下可见5S、18S及28S三条带出现,说明已提出RNA。5S条带较模糊迁移较快。如果RNA没有被降解,28S rRNA的亮度应当是18S rRNA亮度的两倍,且这两条带都没有弥散现象。加样孔附近有条带表明产物中混有DNA。RNA纯度鉴定及定量可用紫外分光光度计,取2ul+148ul去离子水测A260nm/280nm,比值应在1.8-2.0之间。RNA浓度(ug/ml)=A260x稀释倍数x40。对大多数细胞株来说,一个100ml培养瓶中培养细胞的RNA收率为100-200ug。

7.如暂时不做反转录,,立即放-800C冰箱冻存。

 


贴壁细胞总RNA提取操作流程
 I

细胞长满80%瓶底或皿底,换培养液,第二天提取RNA

 (倒掉培养液,5-10ml冰PBS洗涤细胞2次空干)

加1ml冰TRizoL,用力振荡培养瓶使细胞完全脱落,加样器吹打

(吸入1.5ml离心管,旋涡振荡10秒,室温静置5分钟)
 
加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡10秒,冰盒上静置10分钟
 
(40C,8000rpm,5分钟,)

吸取上层水相0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中,加异丙醇0.5-0.7ml
 
(充分混匀,冰盒上静置10分钟,40C,12000rpm,15分)

弃上清,加75%冰乙醇1ml, 颠倒混匀数次

(40C,12000rpm,15分)

弃上清,沉淀快速风干。但不要完全干燥, 加DEPC处理去离子水50-100ul

 

 取5ul作RNA电泳,5ul作RNA定量,余-800C冰箱保存



(二).组织中RNA提取

 1.组织收集:新鲜组织立即放入液氮中30分钟以上后,可在-800C冰箱保存,数月内不会影响RNA的产量及质量。

 2.取组织50-100mg放入1ml玻璃匀浆器中,加入1mlTRizoL,在冰浴中研磨,悬液转入1.5ml离心管中,室温静置5分钟,使核蛋白完全从核酸上解离。高速冷冻离心机(温度设定40C)12000/分离心5分钟,上清液倒入另一1.5ml离心管中。

 3.以下步骤同培养中细胞RNA提取法(2-7)。

 (三)外周血白细胞RNA提取

 1.抽取静脉血5ml,注入0.5ml 3.8%枸橼酸钠(血液:抗凝剂=10:1)的抗凝管中,加盖颠倒混匀2-3次。

 2.将上述抗凝血倒入15ml离心管中,加5mlPH7.4的磷酸盐缓冲液(PBS)等量稀释。

 3吸取5ml淋巴细胞分离液(上海华精生物技术公司生产)加入另一15ml离心管中。

 4.将稀释后的抗凝血10ml沿管壁缓慢加到淋巴细胞分离液上,水平离心机2000转/分离心20分钟。

 5.吸取中间白细胞层至另一15ml离心管中,加入5mlPH7.4PBS缓冲液混匀(洗涤白细胞),4000转/分离心5分钟。弃去上清液,所得白色沉淀即为单个核细胞,如暂时不提取RNA,立即-800C冰箱冻存。

 6.加入TRizoL(Invitrogen生命技术公司生产)1ml,用加样器吹打均匀,吸入1.5ml离心管中,漩涡混匀器振荡30秒,室温静置5分钟,使核蛋白完全从核酸上解离。

7.以下步骤同培养中细胞RNA提取法(2-7)。

三.反转录

参见不同厂家试剂盒说明书,以本室使用的Fermentas MBI公司(#K1621)cDNA反转录两步法试剂盒为例。一步法是将反转录及PCR反应的所有试剂加在一个反应体系(EP管),缺点是试剂用量大,反应条件不好掌握;两步法是先反转录,然后进行PCR反应。

反转录反应

(1)在超净台中,取DEPC处理的200μlPCR管置冰上,依次加入

       总RNA                        1μg(2ul)

       随即引物(0.5μg/μl)         1μl

       无RNA酶水                   9ul至总体积12μl

       混匀,用微量离心机离心3000转/分30秒。

(2)置PCR仪上70℃5分钟变性,取出置冰上冷却。

(3)PCR管置冰上,依次加入

       5×RT Buffer                       4μl

       RNase inhibitor(20U/μl)           1μl

       10mM dNTP Mix                     2μl

       混匀,用微量离心机离心3000转/分30秒。

(4)置PCR仪上25℃5分钟。取出置冰上冷却。

(5)加入M-MuLV逆转录酶(200U/μl)1μl至终体积20μl。

(6)置PCR仪上按以下条件进行

       25℃                               10分钟

       42℃                               60分钟

       70℃                               10分钟

    立即冰上冷却,产物cDNA即用于PCR或置-20℃冰箱保存。

四.PCR反应

(1)取200μIPCR管依次加入

       2×PCR Master Mix                    12.5μl

       cDNA                                2.0μl

       上游引物                            1μl

       下游引物                            1μl

       灭菌去离子水                        8.5ul至25μl

用微量离心机离心3000转/分30秒混匀。

(2)按以下条件进行PCR反应:

        94℃        5分钟             预变性

        94℃        30秒              变性

        55-60℃     45秒              退火

        72℃        45秒              延伸,共30-35个循环

72℃        7分钟             最终延伸。

五.实验对照

1.阳性对照:采用已知高表达细胞的总RNA进行逆转录和PCR扩增。

2.阴性对照:用灭菌去离子水代替总RNA的反应体系进行逆转录和PCR扩增。

3.内参照:以引物进行PCR反应的同时,以β-actin引物(或者GAPDH引物)进行PCR反应。

六.琼脂糖凝胶电泳

   取内参照扩增产物及PCR产物15ul+3ul 6x上样缓冲液,同时用相应的5-8ul DNA Marker,2%琼脂糖凝胶电泳,电压110-120V,30-45分钟。

七.紫外分析仪观察、数码照相

于紫外透视仪下观察有无特异性扩增带,并照相记录。

β-actin扩增产物大小540bp,340 bp。

   GAPDH扩增产物大小142bp。

 

1、载玻片的处理:

抗原修复过程中,由于高温、高压、辐射等诸多因素的影响,极易造成脱片。为保证试验的正常进行,可选用我公司提供的ZLI-9001 APES、ZLI-9003 HistogripTM或ZLI-9005 Poly-L-Lysine等几种试剂,对已清洗的载玻片进行处理。具体方法如下:

1.1 APES:现用现配。将洗净的玻片放入以1:50比例丙酮稀释的APES中,停留20~30秒钟,取出稍停片刻,再入纯丙酮溶液或蒸馏水中涮去未结合的APES,置通风橱中晾干即可。用此载玻片捞片时应注意组织要一步到位,并尽量减少气泡的存在,以免影响染色结果。

1.2 HistogripTM:将洗净的玻片放入以1:50比例丙酮稀释的Histogrip液中,停留1~2分钟,然后用双蒸水快速清洗三次,室温干燥或60oC烤箱烘烤一小时,装盒备用。

1.3 Poly-L-Lysine:将洗净、干燥的载玻片放入以1:10比例去离子水稀释的多聚赖氨酸溶液中,浸泡5分钟,60oC烤箱烘烤一小时或室温过夜干燥。装盒备用。试验中使用的器具均为非玻璃制品。

2、常用酶消化:

2.1 胰蛋白酶:一般使用浓度为0.05%~0.1%,消化时间为37℃、10~40分钟,主要用于细胞内抗原的显示。

2.2 胃蛋白酶:一般使用浓度为0.4%,消化时间为37℃、30~180分钟,主要用于细胞间质抗原的显示,如:Laminin(层粘蛋白),Collagen IV(IV型胶原)等。

2.3 g/ml的saponin溶液,消化时间为室温孵育30分钟。?皂素(Saponin):一般使用浓度为2~10

3、抗原热修复:

可根据实验室的具体条件,选用微波炉抗原修复、高压锅抗原修复或水浴高温抗原修复。抗原热修复可选用各种缓冲液,如TBS、PBS、重金属盐溶液等,但实验证明,以0.01M枸橼酸盐缓冲液(pH6.0)效果最好。请选用我公司提供的ZLI-9064 ?枸橼酸盐缓冲液(粉剂)配制,取该粉剂一包溶于1000ml的蒸馏水中,混匀,其pH值在6.0 0.1,如因蒸馏水本身造成的pH值偏差,请自行调整。

3.1 石蜡切片微波炉抗原修复操作方法:切片脱蜡至水后,3%H2O2处理10分钟,蒸馏水洗2分钟×3。将切片放入盛有枸橼酸盐缓冲液(工作液)的容器中,置微波炉内加热使容器内液体温度保持在92℃~98℃之间并持续10~15分钟(注意:无论是使用医用或家用微波炉,请根据具体机型酌情设置条件,务必满足以上步骤中对温度和时间的要求)。取出容器,室温冷却10~20分钟(注意:不可将切片从缓冲液中取出冷却,以便使蛋白能够恢复原有的空间构型)。PBS洗,下接免疫组化染色步骤。

3.2 石蜡切片高压抗原修复操作方法:切片脱蜡至水。将1500ml~3000ml的枸橼酸盐缓冲液(工作液)注入不锈钢压力锅中加热至沸腾。切片置于金属架上,放入锅内,使切片位于液面以下,盖锅压阀。当压力锅开始慢慢喷气时(约加热5~6分钟后),计时1~2分钟,然后将压力锅端离热源,冷水冲至室温后,取下气阀,打开锅盖,取出切片,蒸馏水洗后,PBS洗2分钟×3,下接免疫组化染色步骤。

3.3 石蜡切片电炉煮沸抗原修复操作方法:切片脱蜡至水后,放入盛有枸橼酸盐缓冲液(工作液)的容器中,并将此容器置于盛有一定数量自来水的大器皿中,电炉上加热煮沸,从小容器的温度到达92℃~98℃起开始计时15~20分钟,然后端离电炉,室温冷却20~30分钟,蒸馏水冲洗,PBS洗,下接免疫组化染色步骤。

4、免疫组化染色步骤:

(以美国ZYMED公司SP试剂盒为例)

石蜡切片脱蜡至水。

3%H2O2室温孵育5~10分钟,以消除内源性过氧化物酶的活性。

蒸馏水冲洗,PBS浸泡5分钟,(如需采用抗原修复,可在此步后进行)。

5~10%正常山羊血清(PBS稀释)封闭,室温孵育10分钟。倾去血清,勿洗,滴加适当比例稀释的一抗或一抗工作液,37℃孵育1~2小时或4℃过夜(两次温箱1小时,效果都很差。这次用4度过夜看看)。

PBS冲洗,5分钟×3次。

滴加适当比例稀释的生物素标记二抗(1%BSA-PBS稀释),37℃孵育10~30分钟;或滴加第二代生物素标记二抗工作液,37℃或室温孵育10~30分钟。

PBS冲洗,5分钟×3次。

滴加适当比例稀释的辣根酶标记链霉卵白素(PBS稀释),37℃孵育10~30分钟;或第二代辣根酶标记链霉卵白素工作液,37℃或室温孵育10~30分钟。

PBS冲洗,5分钟×3次。

显色剂显色(DAB或AEC)。

自来水充分冲洗,复染,封片。

冰冻切片免疫组化染色步骤

m,室温放置30分钟后,入4℃丙酮固定10分钟,PBS洗,5分钟×3。用3%过氧化氢孵育5~10分钟,消除内源性过氧化物酶的活性。PBS洗,5分钟×2。?冰冻切片4~8

下接免疫组化染色操作步骤。

一.所需仪器设备

1.电泳仪

2.垂直电泳槽

3.转移电泳槽:湿转或半干转电泳槽

4.硝酸纤维素膜(NC膜)

5.暗盒

6.5x7cm X胶片

[注:电泳槽、玻璃板、梳子及胶条的清洗:自来水冲洗数次――去离子水冲洗数次2次――37C烤干备用。]

二.所用试剂

[注:配制及稀释试剂均用去离子水,实验器皿自来水清洗完毕再用去离子水冲洗]

1.Lysis buffer:RIPA 三去污剂裂解缓冲液

 50mM Tris.Hcl                                  3.03g

  150mM NaCl  生理盐水                           4.35g

  0.02%NaN3(防腐剂,可以不加)                  0.1g

  0.1%SDS  强阴离子去污剂                        0.5g

  1% NP-40 去污剂                                5ml

  0.5% Sodium deoxycholate 去氧胆酸钠  去污剂    2.5g

配制500ml,10M盐酸调PH8.0, 4度保存。

使用前按1:50加入100mM PMSF(苯甲基磺酰氟,平时放-20度)和protease inhibitor(先溶在2ML水中,分装在小管中,保存在-20度),配好后马上使用。也可分装成(RIPA300ul+6ul100mM PMSF+6ulprotease inhibitor)(培养细胞及微小组织蛋白提取)若干管,-20度保存;分装成(RIPA1000ul+20ul100mM PMSF+20ulprotease inhibitor)(较大组织蛋白提取)若干管,-20度保存。

[注:也可使用单去污剂裂解缓冲液,将1% NP-40换为1%Triton X-100。去掉0.1%SDS及0.5% Sodium deoxycholate 去氧胆酸钠]

PMSF储存液 100mM(17.4mg/ml),溶于异丙醇。有效浓度100ug/ml。

2.150mM Nacl(0.87%Nacl,生理盐水)

3.0.1mg/mL考马斯亮兰G-250溶液 蛋白定量用。用50ml 95%乙醇溶解100mg考马斯亮兰G-250,再加入100ml 85%磷酸,加水至1000ml。用Whatman滤纸过滤后,置棕色瓶4度保存。蛋白定量比色皿可用95%乙醇脱色。

4.考马斯亮兰脱色液 含50%甲醇、10%冰醋酸、40%去离子水。

5. 0.25%考马斯亮兰R-250溶液 染色用。100ml脱色液中加入0.25g考马斯亮兰R-250。

6.10mg/mlBSA,称取100mg小牛血清白蛋白溶于10ml灭菌去离子水中。置-20度冰箱保存。

7.1mol/L Tris-Hcl缓冲液,PH6.8

8.1.5 mol/L Tris-Hcl缓冲液,PH8.8

9.10% AP:过硫酸铵(Ammonium Persulfate,AP),Amresco分装,为促凝剂,现配现用,准确称取AP 20mg于0.5ml离心管内(注:称量时可分装数管室温保存备用)临用前加去离子水200ul溶解。配制好的AP溶液4C可保存1周。

10.TEMED,Amresco分装,100ml包装,为促凝剂,准确吸取TEMED 10ul于0.2ml离心管内,可分装数管室温保存备用。

11.10% SDS  在90ml去离子水中溶解10g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至7.2,加入去离子水定容至100ml,室温保存。

12.30% Acr  将29g丙烯酰胺和1gN,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中,加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用Nalgene滤器(0.45孔径)过滤除菌查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中4度保存。

13.6xLoading buffer:6倍sample buffer

300mM tris.Hcl pH=6.8  , 12% SDS ,0.6% bromophenol blue (溴酚蓝),60%Glycerol,甘油

Filted,分装在1ml tube, 每毫升加43ul B-ME(β-巯基乙醇,还原剂),-20度保存。

14.蛋白Marker:  选择最适分子量Marker(MBI公司蛋白Marker很好)

15.内参:可选择最适分子量内参做1:3000-5000稀释,如B-Actin(45KD,浆蛋白用)、GAPDH(36KD,浆蛋白用,上海康成生物经销)、B-Tubulin(核蛋白用)等。

16.1xTris-Glycine电泳缓冲液(PH8.3)

25mM tris,192mM Glycine, 0.1%(w/v)SDS,

500ml配方如下

Tris1.515g, glycine7.2g, SDS0.5g用去离子水加至500ml。加10M HCl约800ul,就可以调至pH8.3。

17.1xTransfer buffer(PH8.3)

25mM tris, 192mM Glycine, 20%Methanol(甲醇),ph为8.3

 500ml配方如下

Tris 1.515g,glycine7.2g,100ml Methanol(甲醇),用去离子水加至500ml。加10M HCl约550ul,就可以调至pH8.3。

18. TBST Washing buffer:

50mM tris, 150mM Nacl, 0.1% Tween-20

1L配方如下

Tris 6.06g,NaCl8.7g,1mlTween-20,加入去离子水至1L,同时精确调准pH值为7.6。加10M HCl约4200ul,就可以调至7.6。Tween-20要在用前现加,未加Tween-20的称为TBS缓冲液。

19.5%的脱脂奶粉封闭液  用TBST Washing buffer配制。

20.一抗:santa原装或北京中山分装,一般做1:200-300稀释。

21.HRP标记二抗:一般做1:3000-5000稀释。二抗选择原则如下:

  如一抗为鼠抗人IgG, 二抗选择羊抗(或兔抗)鼠HRP;

如一抗为羊抗人IgG, 二抗选择鼠抗(或兔抗)羊HRP;

如一抗为兔抗人IgG, 二抗选择羊抗(或鼠抗)兔HRP。

22.ECL化学发光显色剂,或DAB显色剂

三.总蛋白质提取

1.培养细胞

1.1贴壁细胞数目达到培养皿(或培养瓶)底面积80-90%,最好前一天换上新的培养液。

1.2将培养液吸净,用5ml左右4度PBS洗三次细胞平皿(洗净培养液中的胎牛血清等外源性蛋白),将PBS吸净,加入triple-detergent lysis buffer,100mm培养皿加300ul。(蛋白质种类不同—浆蛋白、核蛋白、膜蛋白,细胞裂解液有所不同)如暂时不提取,可将培养皿-80度保存。

1.3轻轻的转动培养皿直到细胞被溶解下来,细胞刮轻轻刮下裂解物,并可见白色的核酸(DNA、RNA)沉淀,(约1分钟)将所有的液体包括沉淀,吸入1.5ml离心管,旋涡混匀器30秒,放在冰上10分钟使细胞充分裂解,然后,用4度离心机12000转10分钟。

1.4留10ul上清液做蛋白定量外,其余上清于另一1.5ml离心管(将蛋白样品5份+1份6×loading buffe,6×loading buffe加入前用80度左右的水预热一下,使其溶解充分。把样品在100度的沸水中煮5分钟使蛋白变性,离心管上标明蛋白含量,保存在-80度冰箱)

2.组织中蛋白提取

2.1特小的组织加300ulLysis buffer玻璃匀浆器中,冰浴中研磨数次,匀浆上清液吸入1.5ml离心管中,然后,用4度离心机12000转10分钟。吸取上清于另一1.5ml离心管,分装,保存在-80度冰箱。留10ul上清液做蛋白定量。

2.2取50-100mg组织放入玻璃匀浆器中,加3倍体积Lysis buffer,冰浴中研磨数次,匀浆上清液吸入1.5ml离心管中,然后,用4度离心机12000转10分钟。吸取上清于另一1.5ml离心管,分装,保存在-80度冰箱。留10ul上清液做蛋白定量。

四.蛋白质定量

1.应用标准的Bradford法定量。

2.待测样本各10ul+90ul生理盐水;标准管中分别加入10mg/mlBSA 0ul、2.5ul、5.0ul、7.5ul、10ul, 每管加生理盐水至100ul(蛋白含量分别为0、25、50、75、100ug),同时以100ul的生理盐水作空白对照。各管加入考马斯亮蓝染料溶液1900ul至总体积2ml,混匀,室温放置2分钟。比色检测作标准曲线,计算出各个样品的蛋白含量。

3.比色定量:通过OD值,来计算蛋白量。统计软件计算出结果;

五.样品准备

1.将已定量的蛋白样品5份+1份6×loading buffe,6×loading buffe加入前用80度左右的水预热一下,使其溶解充分。把样品在100度的沸水中煮5分钟, (水中煮沸5分钟,目的是让蛋白变性,由四级结构变成一级结构。注意事项:煮沸时,一定不要让离心管口弹开进入水,要随时观察。)

2.一般来讲蛋白上样量30ug;计算出每个样品30ug所用的体积,在样品管上标记体积数值,以后直接吸取就行了。

3.等体积上样:用事先准备好1×loading buffer,调成15ul相同体积。这样条带整齐。

六.蛋白电泳

1.分离胶制备

1.胶的选择:胶的浓度越大,所能分离蛋白的分子量越小。(阿恒觉得这里一般还是10%到15%的比较常用)

7.5% :45—200KD

10%: 31----200KD

12%: 21.5---200KD

15%6.5---200KD

2.10ml 10%分离胶制备

   去离子水                  3950ul

   30%Acr                    3350ul

   1.5MTris-Hcl,PH8.8        2500ul

   10%SDS                     100ul

   混匀;依次快速加入10%AP 100ul及TEMED 4ul,充分混匀但不要产生气泡。(这部很关键)

3.立即灌胶,不要产生气泡,如有气泡可用10ml注射器针头排除。在每侧胶板加胶至红色塑料板的下缘处即可(差不多4-5ml)

4.沿玻璃板壁缓慢加去离子水1cm高度,隔绝空气,分离胶室温凝固2小时以上。也可4度冰箱过夜。

2.5%积层胶制备

(配制积层胶前先倾斜玻璃板,使上面水层汇聚于一边,用10ml注射器吸取干净,静置10分钟左右,使水分蒸发干净)

2.1 4ml 5%积层胶制备

   去离子水                  2800ul

   30%Acr                     660ul

   1MTris-Hcl,PH6.8           500ul

   10%SDS                      40ul

混匀;依次快速加入10%AP 40ul及TEMED 4ul,充分混匀但不要产生气泡。立即灌胶,不要产生气泡,如有气泡可用10ml注射器针头排除。

2.2插上梳子,积层胶室温凝固30分钟以上。小心拨出梳子,若胶孔有歪斜,则用注射器加以修正,吸出气泡;(歪斜一般出现在基层胶凝固时间过短,或者配置比重过低,可用针头拨乱反正之,但是难度很高,容易挑破)

2.3去掉胶条,加入甘氨酸电泳缓冲液,内外持平;

2.4清洗胶孔:去除没有凝聚的Acr,并清除气泡。

3.点样:使用20ul的加样枪,采用“对侧加样法”加样。

4.电泳

电泳在4度冰箱中进行,积层胶90V,30分钟左右,待溴酚兰指示剂到达分离胶表面时改变电压120-130V,2小时左右――此方法可以保持胶内受热均匀,电流、电场均匀,条带齐规整)

5.剥离胶:在平皿中,用手术刀片小心剥离,切掉积层胶,取出分离胶,用于下一步试验。

七.转膜

1.准备一大的玻璃培养皿,

2.Tansfer buffer:配制500ml(一部分倒于玻璃皿中,以分离胶-制作夹心饼);取胶-修剪胶:取胶时手应错开分离玻璃,使胶取出,去掉积层胶部分,修剪周边使其与预先制作好的硝酸膜大小一致,约长8cm、高5cm左右,NC膜用剪刀在一个角剪一个标记;制作夹心饼:黑负白正,从近负极面依次为“黑夹板=海棉-滤纸(5层)-胶-膜-滤纸(5层)-海棉=白夹板”形象“汉堡”或“夹心饼”;用玻璃棒赶尽气泡](这步要一层层的赶气泡,气泡非常影响转膜结果)

3. Transfer time

4度6-12小时(4C转膜过夜,时间根据分子量的大小调整,大分子可以12小时,小的6小时左右)

4.将膜取下,用去离子水洗。

八.Western blot

blot之前可以用丽春红(ponceaus)染NC膜,以观察蛋白转膜情况(是否完全、条带是否齐)。然后用自来水或washing buffer洗掉丽春红后进行印迹。可以跑两块胶,一块blot,一块染色观察。(其实,恩,染过色的胶洗掉还是可以用的,吼吼!)

步骤:

1.裁膜:根据电泳后蛋白Marker的位置,裁剪所需目的蛋白、内参对应的膜。

2.封闭抗体:将膜放入自制blot袋;封闭液用5%的美国脱脂奶粉(用TBST wash buffer配制),blot with milk for 1h RT,也可4度过夜。(这个做袋袋,也是很有意思地 = = 哈哈!)

3.加一抗:blot in primary antibody for 1.5h RT(抗体用milk稀释)

4.洗膜:wash with TBST wash buffer 5times, each time 3mins

5.加二抗:blot in secondary antibody 1h RT (抗体用milk稀释)

6.洗膜:wash with TBST wash buffer 5times, each time 3mins

九ECL显色

1.加ECL试剂10ml于100mm玻璃培养皿中,再加30%双氧水6ul(带上手套,防止腐蚀皮肤)(万一腐蚀了,皮肤变成白色的,又疼又养,这是一个比偶倒霉的哥哥告诉偶的),摇匀。

2.用滤纸吸干NC膜上水分,将膜放入ECL显色液中显色,肉眼看到条带后,就可以取出,显色强的约几秒钟,显色弱的时间长些,但是不可以超过3分钟。

十.放射自显影,冲洗胶片

1.放射自显影操作在暗室进行。红色灯光下可避免底片曝光。切忌底片湿水。

2.用滤纸吸干膜上ECL显色液,先将膜放入暗盒内,再放X胶片,根据目的条带ECL显色的强弱决定曝光时间。 (伸手不见5指的曝光,经常大眼瞪小眼的看条带)

3.目的条带ECL显色肉眼可以看到的话,说明比较强,曝光时间可以短些,“3分钟、5分钟各一张+必不可以少的10分钟一张”;肉眼看不见,曝光时间可以长些,“不可以少的10分钟,15分钟、30分钟各一张”。

4.一般来说,曝光三张已足够用。(偶一口气爆上6张,左眼看3张,右眼看3张,嘿嘿~~)

5.放射科冲洗X胶片,读片。

6.X胶片扫描保存。

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